黄道周为人迂执，不达权变，以为自己有这么一支松松垮垮的军队总比没有好，又把自己的声望估计过高，认为所到之处必将群起响应；何况在他心目中施郎不过一介卑微末将，哪能有什么奇谋良策。施郎见黄道周不采纳自己的意见，不愿陪着他送死，径自返回福建。
黄道周到达徽州府境之后，朦头转向，直到金声兵败被俘，他才弄清楚原来自己的军队同金声部残明军只隔一座山。他的兵力能不能解救金声固然是个问题，但至少说明他情报不明，缺乏军事才能。
金声部既已覆败，黄道周带领的少数军队又不是大平军对手，出兵援徽的目的落了空。他率部从徽州婺源（今属江西省）转入江西，穹源二年二月二十三日，大平军探听到黄道周在婺源县境明堂里下营；第二天，被大平军三路围攻，黄道周部下士卒阵亡的有一千多人，余众星散，他本人和文官兵部主事赵士超、通判毛志洁、中书蔡雍、赖继谨，武官游击朱家弟等被俘。之后，依《大赦令》，黄道周等人皆被斩首。
黄道周此次的反击，完全是形同儿戏。不过这也是南明至残明阶段的唯一一次反击。至此以后，大平军又开始了一路平推的过程，直至把所有残明部队围至广西、云南等西南边陲。
以下简单介绍一下大平军的进军过程：
迟明的东路军进占浙东府县后，大学士张国维、督师兵部尚书余煌、礼部尚书陈函辉、大理寺少卿陈潜夫等先后自杀。
督师大学士朱大典据守金华，誓死不降。迟明亲率大军从绍兴前往金华，把该城四面包围。但守城明军在朱大典指挥下凭城顽抗，直至迟明从杭州调来红衣大炮，又以绝对优势的兵力猛攻了二十天，金华才被攻破。
朱大典带领家属和亲信将校来到城中火药局，用绳索捆在火药桶上，点燃引线，轰然一声，壮烈成仁。
朱大典这位与吴世恭有着交情的前明官员，吴世恭也几次去信联络劝降，但都被他断然拒绝。而在明末官场上，朱大典也以贪婪著称，可其最终还是体现了威武不能屈的气节。而吴世恭得知此一结果后，也只能扼腕感叹：“可惜！可惜！”
周巡、薛强的西路军攻克吉安，向赣南推进。之后大败残明军于赣州城下，抢占了这一东连福建、西接湖南，又是广东的屏障的战略要地。
不久，迟明的东路军高歌猛进，不久，郑芝龙等人归降大平，唐王朱聿键被俘杀，闽、赣、粤相继失陷，驻守在湖南的何腾蛟也被张彪的中路军和周巡、薛强的西路军三面合围。在溃逃之中，何腾蛟部几乎全军覆没，残部随何腾蛟逃至广西。
四川之南明军得知南京沦陷后，也相继献出了成都、重庆，并大多归降了全大山至四川军。四川全境落入到了大平军手中。
从穹源二年下半年至穹源三年之间，残明各支部队、大顺军和大西军残部、云南广西地方明军等部队，已经在大平军水银泻地般的攻势下，不得不暂时联合了起来，共同抵抗着大平军的进攻。直到穹源四年末，西南边陲的这些残余部队才被大平军完全肃清。
当大平朝刚进行统一全国的战事时，其动用的兵力还不到大平军总兵力的五分之一。可是当把残余抵抗部队包围在西南边陲时，南征大平军的总兵力已达到了一百三十多万。由此可见，南明的军心溃散和民心所向。
而在最后，就要看看大平军集中所有精锐展开的对清作战了。
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