宋建炎元年五月，大宋北伐军凯旋陈桥驿，三大主将领全军十余万将士奏请天子禅位鲁王，宋朝最后一位皇帝，第一位女皇帝赵嬛嬛欣然应允，颁下禅位诏书，祭告宗庙后，便将帝位传位鲁王扈岚。
扈岚得承帝位，诏命群臣，建号大元，定都燕京为中京，仿宋例定五京，以会宁府为北京，开封为南京，山东济州府自己发迹之地为东京，山西太原府为西京。三娘定五京，首次有关外州府为京，又将都城定在燕京，显示了她想要控制北地，彻底断绝来自漠北游牧族的威胁。
本来群臣大多都反对迁都燕京的，原因很简单，燕京那里人口太少，水运漕运也不及开封便利，实在不是帝都的首选，但三娘还是力排众议，定下便在次年迁都，便还有一年时光准备。
定下国号与国都之后，三娘改年号为宣武，以次年为宣武元年，册封鲁王世子扈宗明为太子。改宋朝官制，建立元朝官制，正式建立中书省总理政务，以太子扈宗明为中书令，此后中书令均由元朝皇太子兼领，定为虚衔。中书高官官，中书令以下，设左、右丞相为实任的宰相，以宗泽为左相，宿元景为右相。下设平章政事四员、左右丞各一员、参知政事两员为副相，以李纲、黄裳、汪藻、杨时为平章政事，黄文炳为左丞，娄敏中为右丞，闻焕章、高俅为参知政事。
扈元朝的中书省自中书令以下，实权人物共有十人，便是替皇帝掌控全国军政大事的中枢，中书省也被后世称为十人内阁，得入中书省的都顶着各殿大学士的名号，后为常例。
军事上，三娘保留了枢密院，设枢密使正副各一人，以种师中为枢密使，卢俊义为枢密副使，种师中年事已高，其实枢密院的实权都在卢俊义手中。再设枢密院同治六人，分别委以关胜、岳飞、林冲、王禀、王彦、呼延灼六人出任。枢密院在三娘的官制体系中更偏向实际领军作战，自扈元朝开国之后，每遇战事都是枢密院内将领出征领军作战。
枢密院内还设参谋部、情报司、海军部三个要害部门。参谋部便是枢密院评估周边诸国实力，推演与假想敌作战方略，拟定各种作战计划，编练天下军马之地。情报司顾名思义便是搜集情报的地方，情报司是偏重军事情报搜集，处于明面上的情报机构，而锦衣卫始终是三娘亲自掌管的大内情报机构，二者互不重叠。海军部便是掌管天下海军的部门，编练天下海军、内河水军，沿岸、沿河防务都属这个部门。
参谋部便是朱武为首，官拜枢密院佥事，下首有唐斌、文仲容、孙安、李应、朱仝、杨志六员大将为辅，官拜枢密院院判。情报司以燕青为首，官拜枢密院佥事，下首马灵、郑鹰、时迁、白胜四人为辅，官拜枢密院院判。
海军部以李俊为首，旗下辖四大海军舰队并长江、黄河两大南北水系内河水军。四大舰队便是北海舰队、南海舰队、东海舰队以及远洋舰队，分别以阮小二、阮小五、阮小七、张顺为提督，总领四大舰队，“赤须龙”费保、“卷毛虎”倪云、“瘦脸熊”狄成、“太湖蛟”卜青四人分为四大舰队副提督。另有张横为内河水师总提督，童威童猛两兄弟分别为南北水师提督。
枢密院下设六部，与宋制相同，也一般的是吏部、工部、户部、礼部、刑部、兵部。每部尚书改为一员，每部侍郎改为六人，每部配属簿书、文吏、算官若干。
凡分受官员禀奏，吏部主管封赏之外，还要管各地官吏的任免、官吏的年绩核考、官吏升迁降职等事务。与宋制不同的是，三娘将各州县小吏也定了品级，正式纳入官员体系，也一般的有升迁调度，而不是像宋朝那样，小吏永远只是小吏，干了几十年还是一个小吏，而且小吏也能通过考核正式升任官员，只不过考核的内容比较变态，难度很高，除了在任时候的政绩之外，还要有一技之长，然后是严格的考试，考试题目自然是类似后世的公务员考试，只不过扈元朝的公务员考试更注重实用。
户部主管全国钱粮、人丁口数、农田土地数目、各军甲器、各种牲畜数目等，总之户部不仅承担了后世统计局的差事，还兼着渔业部和农业部的差事。本来三娘想要一次性把后勤部和农业部单独剥离出来，但总觉得一下子搞出八部来也太过繁琐，还是精简些机构较好，是以在户部下设了渔业司和农林司。
而兵部这次官制变动最引人注目的就是兵部之下设立的兵甲司和后勤司，这两个司部承担的职责便是把各军统军将领手中的权力剥了过来，钱粮甲器一应军中所需今后由户部这两个司承担，就不再是一军将领掌控全军的钱粮甲器了。这也是三娘早早的把防止手下将领坐大的手段使了出来，只要控制住一军的钱粮甲器命脉，再强的将领也不能掀起什么风浪来，这也意味着三娘对全国军队的控制更加严谨了，今后军队便是国家的军队而不是哪一个将领的军队了。
同时户部还加入了关税司，也就是负责海外贸易的关税收取，海商出海必须先交关税，而将后来的市舶司功能都加在了关税司的职责上。
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