当时殖民者们只能心惊肉跳地等待，马尼拉笼罩在绝望和萧条气氛中。
那时的西班牙驻菲律宾总督阿库尼亚一面做些表面工作，如部分发还明侨商人的财产，发动幸存者给国内写信，企图证明西班牙殖民者“清白”；一面派特使奎瓦携带致广东、福建两省巡抚和其他官员的函件。
他于1603年12月10日乘船前往澳门，并趁机刺探大明政府有否进攻菲律宾打算的军事情报。考虑到澳门的葡萄牙人对大明比较了解，阿库尼亚还写了几封信，详述明侨起义事件，并附上致大明官员函件的副本，让奎瓦分发给澳门的司令官、主教、在政务方面有着较大发言权的耶稣会教士等。
但葡萄牙人出于打击贸易竞争对手的考虑，始终未将函件转交大明方面。葡萄牙人非常在乎每一次屏蔽大明的机会……只有他们才是大明的老朋友。
直到奎瓦等人抵达澳门的消息传到漳州，有经常往来漳州和马尼拉的大明富商到澳门与其会见，答应把函件转交大明官员，设法动员明侨继续贸易。
奎瓦当时在澳门了解到，明朝政府已获悉屠杀事件，但全国平静，没有集结舰只进攻马尼拉的迹象。获得这个重要情报后，奎瓦购买了一批军事物资，于5月回到马尼拉。
事实上，尽管明朝当局了解了事件真相，但它一贯把移民国外的明侨视为贱民，因此仅写了一份《谕吕宋檄》，于1605年5月底、6月初由大明贸易船队中一名船主带到马尼拉，分交菲律宾总督、马尼拉最高法院和马尼拉大主教。
檄文未对屠杀行为进一步严加追究，只要西班牙殖民当局保证明侨今后生命财产的安全，并宣布对殖民者“不忍加诛”，“其海外戕杀姑不穷治”，要求西班牙方面“当思皇帝浩荡之恩，大明仁义之大”。
这事情的处理，还真不能一味责备明朝。
明朝未出兵讨伐还有当时现实条件的限制。
在西班牙屠杀明人大致同一时期，大明王朝进行了三场大规模战争：在西北的宁夏，西南的播州，特别是从万历二十年（1592）开始的长达7年与日本在朝鲜进行的战争。
这三场大战明朝都取得胜利，但国家军事和财政能力损耗极大。
明朝的被迫纵容使得殖民者对菲律宾明侨的欺压更加有恃无恐，绝境中的明侨不堪其苦。
1639年，明侨们再次发动起义，并坚持近4个月。
这一次，西班牙殖民者彻底杀红了眼，无数明侨平民包括虔诚的天主教徒死于屠杀。
这一次又让马尼拉市场上一片萧条，再加上外有荷兰东印度公司的有意打压，西班牙殖民者只能依靠着从美洲运送来白银苟延残喘……
汉唐集团事先做出了一个总的估算，他们认为美洲白银的产出在16世纪约为17000吨，17世纪的约为42000吨……当然，现在17世纪只是过了一半。
其中，美洲白银流入到明大陆的主要方式和主要路径，就是船运，西班牙人用后世有名的马尼拉大帆船启运，通过阿卡普尔科到达马尼拉，然后在与东方的直接贸易中流出。
根据各项数据，汉唐集团认为明代时大陆从马尼拉贸易中得到的白银为87，750，000两，即11700万比索，约合现代计量单位为4212吨。
而与此同时，美洲白银通过太平洋运到菲律宾的数额，总共达到4620吨。
不过汉唐集团还有另一份资料。就是从1563年开始，波托西等地银矿采用水银分离纯银的方法，使白银开始进入产量激增的时期。
马尼拉大帆船航线开通后，以平均每年150吨来计算，这20年共运输了3000吨白银。
考虑到运至马尼拉的白银基本上都流人了明大陆，因此，综合起来，1570-1644年通过马尼拉一线输入明大陆的白银约7620吨。
这两笔算法明显有差异，但汉唐集团跟本不在乎……他们想要的可不仅仅是这些。
由此也可以看出明大陆沉淀了多少白银。
不过，也正因为如此，西班牙国内竟有人提出放弃菲律宾的提议。
原因是菲律宾吸走了美洲太多的白银了……汉唐集团很是注意到这个人的资料，还不错，此人在西班牙地位还是挺高的……
汉唐集团的到来，直接为西班牙人清除了第一个压力……明大陆来菲律宾做生意的明商数量显著提高。
西班牙殖民者搭了汉唐集团的便车，利用汉唐集团的战争结果，为自己打开了商贸大门，却对汉唐集团没有丝毫表示感谢……更重要的是，还有两笔血债还没有考虑补偿，这个问题很严重啊。
但是，现在好像还不是能够算账的时机，西班牙人还是汉唐集团重要的一枚棋子，汉唐集团对他们固化的阶层制度，虔诚的天主教意识，更有那遍布全国的宗教裁判所感到满意……我们的经历都不算啥，想要比烂，机会真多啊。
汉唐集团只能捏着鼻子认同他们……只能在心中有怨念。
可是，汉唐集团心中的怨念丝毫没有影响到菲律宾总督查孔吃早饭的心情。
这几个月来，菲律宾马尼拉的市场慢慢繁荣起来，各项税收也开始猛涨……菲律宾总督查孔今天早上多吃了几片面包。
菲律宾总督查孔刚刚在办公室里坐好，他的侍从官就把商人议会的议长领了进来……那议长把自己或者大多西班牙商人的想法说了出来。
菲律宾总督查孔微笑着说：“你们确定要入那个汉唐集团的股份？那希望我们为你们做些什么？”
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