就此展开的科学院第二次神国清理计划，一开始也正如安德鲁斯的预料般，那些完成第一个算是教学任务世界试炼任务世界后，就被投入勇敢者游戏的平均E级玩家们，一开始果然是用数量压倒了质量。不到现实时间一个月，勇敢者游戏区中的三成新世界都被确实如同蝗虫般的他们前仆后继的毁灭了。
但是可惜的是，正在安德鲁斯最高院士，因为这顺利的战况，宣布科学院要在半年内完成神国清理任务后，勇敢者游戏区中的好势头，就突然急转直下了。
原因吗？也很简单。新世界中的新神祗和他们的那些造物们，毕竟不是死脑筋只会硬打硬抗的低等级虫子。发现无法正面对抗那些蜂拥而至的玩家们，他们就非常迅速的转变了应对方式。
拉拢、分化、打压等等等等，使用出各种手段的新神祗和他们的造物们，很快就让那些玩家们明白，除了和他们为敌，与他们合作在很多时候是可以获得更多收获的——很多系统无法给予的收获。
所以，悲剧性的就如同安德鲁斯最高院士的宣言，科学院第二次神国清理计划，在半年以后结束了。只是，以一场被称为第二次诸神之战的，源源不绝忠于系统的新玩家、新神祗和他们的造物、以及与那些神祗合作获得了强大实力但还想要更多的旧玩家，这三方所进行的，一场从内打破旧有特殊护壁系统的混战。和四个命运神国区域的被混战最后阶段现身的掌控分身污染，作为结束的第二次神国清理计划，无论如何也称不上成功就是了。
而科学院第二次神国清理计划的失败，也就造成了安德鲁斯最高院士的下台。星历127年，中央科学院选出了新的执行长。而在他的推动下，科学院的第三次神国清理计划展开了。
值得一提的是，由于前两次清理计划的失败，命运神国中被污染的区域数量此时已经抵达了联盟议会所能接受的极限。所以，这次科学院在新的神国清理计划开始前，被被赋予了最终权限。联盟议会批准科学院在必要时，可以彻底销毁与命运神国有关的一切，包括命运神格、掌控神格还有那命运神国中的21254个太阳系，借此保证彻底消灭掌控。
所以实际上，已经获得联盟议会放手指示的科学院新任执行长，是可以直接进行本应作为最后手段的彻底销毁的。甚至为这种没有任何人道可言的行动，做替罪羊的人都是现成的。
要知道，虽然当时科学院内部安德鲁斯最高院士已经下台，但是作为一个向联盟奉献了一生的知名科学家，没有什么光明正大的理由可以直接把他赶下台的联盟议会，还是非常给他留面子的安排了一个病退计划。
也就是说，当时病退计划刚刚执行到第二部分，突然被发现患有某种基因疾病，但是还在坚持工作的安德鲁斯最高院士，至少明面上还是的联盟中央科学院最高院士兼执行长。
不过，既天性纯良又掌握了一些特殊力量的新任科学院李执行长，最后还是放弃了那看似容易的办法。经过精心计划，以他为主导的第三次神国清理计划开始了。
而让很多人都无法理解的，科学院新执行长李院士的第三次神国清理计划开端和幸运病退成功的安德鲁斯前最高院士如出一辙。而由于有第二次诸神之战中幸存的许多神祗、老玩家，乃至当时就作为掌控分身现身的阿斯纳在其中兴风作浪。比上一次甚至更快的，不到现实时间三个月，第三次诸神之战就爆发了。
在第三次诸神之战初期，被许多人诟病的，李院士用他的身份压制了科学院原本的种种应对手段。而趁机做大的掌控分身阿斯纳以惊人的速度完成了神祗和所谓“自由”玩家们的整合，在祂的控制下，一支从未有过的联军成型了。
在联军犀利的攻势下，隶属于安吉拉命运神国管理系统的玩家们溃不成军节节败退。而就在此时，李院士动用了一向是作为科学院底牌的命运神国控制系统母体，被称为命运天使的安吉拉.达斯特尼，率领着众多拥有系统身份，为了辅助她管理神国才进入命运神国并被赋予了神级精神力的信息生命体，加入了对抗阿斯纳联军的玩家队伍。
有了近乎命运神国管理系统的他们帮助，人数还在不断提升的玩家队伍，终于和阿斯纳的联军基本达成了均势。而在这种势均力敌的僵持维持了两个月后，为了打破这种均势，已经基本上恢复战斗力的掌控现身了。
只是当时的掌控并不知道，可以算是祂所有敌人指挥官的李院士，不但早就预料到了祂的出现，也为祂的出现提前准备了足够意外的“礼物”。
现实世界时间，星历127年7月4日晚上7点22分，掌控现身神国世界中，对持两军主战场三分钟后。做为李院士底牌的一种由他发明的特殊精神风暴类武器爆发。
而这种可以在神国世界中发挥最特殊威力，从神国中万物的精神基础上，对攻击辐射范围内所有人事物进行无差别毁灭的精神风暴类武器，所制造的毁灭风暴。就被极少数身处风暴余威边缘，所以没有彻底消亡的幸运儿们，称为第一次毁灭风暴。
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