第一特混舰队是在四月十七日，也就是在第五舰队首次轰炸了尼华岛之后的第三天离开了阿普拉港。同一天与第一特混舰队出发的还有第二特混舰队，第三特混舰队，以及由那三艘修复了的小型航母为核心的战区舰队。战区舰队将不跟随第一特混舰队前往中途岛，而是在关岛附近继续训练，等待登陆舰队与运输船队从那霸那边赶过来之后再前往中途岛。
在出发之前，谈仁皓收到了最后一封消息，第五舰队没有在十七日上午轰炸尼华岛了，而且前往侦察的远程水上巡逻机也没有发现第五舰队。廖汉翔的推断是正确的，从十六日下午的最后一次轰炸之后，第五舰队离开了尼华岛附近海域，消失在了茫茫大海之中。廖汉翔已经电告了在尼华岛东部活动的潜艇，要求尽快找到第五舰队的行踪，可是谈仁皓并不抱多大的希望，潜艇在广泛搜索中的作用是相当有限的，如果斯普鲁恩斯存心要躲起来的话，就会离开帝国海军潜艇活动的主要海域，依靠潜艇的力量是很难找到第五舰队的。
在安排主力舰队的指挥体系时，谈仁皓没有给郝东觉特权，而是让常荐新为主力舰队的临时参谋长，也就是说，如果谈仁皓无法继续指挥第一舰队作战的话，就将由常荐新接替他的指挥工作。这不是谈仁皓觉得郝东觉没有能力指挥第一舰队作战，主要是郝东觉不够稳重。而且，在谈仁皓失去指挥能力的时候，第一舰队的处境肯定相当的危险了，到时候需要的不是郝东觉这种主导进攻的指挥官，而是常荐新这种稳重的，可以率领见队安全的撤出战斗的指挥官，至少，在这方面常荐新还是非常值得信赖的。
三支特混舰队直到下午五点多才全部离开了阿普拉港，第二特混舰队与第三特混舰队很快就追了上来。谈仁皓没有立即让第三特混舰队编入到两支航母特混舰队中来，在航行途中主要需要提防的是潜艇，而不是轰炸机，因此就不能让舰队的编队过于密集，给美军潜艇偷袭的机会。训练工作还得照常进行，两支特混舰队的航空部队都在抓紧一切时间训练，安士乐率领的战斗机就是在天黑了之后才降落到航母上的，这也算得上是一次夜间降落训练吧，一次高风险的训练。
航行途中，三支特混舰队演练了好几种战术，包括将第三特混舰队编入第一特混舰队与第二特混舰队，加强两支航母特混舰队防空能力的训练。另外，还包括了两支航母特混舰队共同打击一个目标，以及分头打击两个目标，甚至是三个目标的模拟作战训练。训练中没有让轰炸机投下炸弹，也没有让轰炸机带弹起飞，主要就是让飞行员熟悉，在遇到不同情况时应该怎么行动，并且让航母上的航空勤务人员热身，提高作业效率。
因为比第三舰队晚了一天出发，所以从十七日晚上七点开始，第一舰队的巡航速度就提高到了24节，这样，第一舰队能够在两天之后，也就是在第三舰队距离中途岛大概还有一天半航程的时候追上第三舰队。至于燃料的问题，谈仁皓没有过多的考虑，中途岛那边有足够的重油与航空汽油储备，廖汉翔也已经与韩绍锋联系了，舰队在到达中途岛附近海域之后就将进行第一次燃料补给，这不需要谈仁皓操心。
谈仁皓最关心的还是斯普鲁恩斯在做什么，在舰队离开了阿普拉港后，他就安排了三名通信军官轮流在那部用来接收战区司令部的电台旁值班，并且要他们在收到任何消息之后立即来汇报上来。而谈仁皓在十七日夜首先收到的就是方孝贤从尼华岛发回了关岛，再由战区司令部转发的损失报告。
在14，15，16日三天的时间里，第五舰队一共轰炸了尼华岛五次，平均每天还不到两次，这个作战出动率并不高。在整个作战行动中，第五舰队距离尼华岛250到300海里，按照这个距离计算，轰炸机一天可以出动三次，至少也能够飞两次。另外，三个白天，第五舰队只出动了大概2200架次的轰炸机，只占这三天内轰炸尼华岛的美军轰炸机出动架次的40％左右，比例并不高，大部分的轰炸任务都是考爱岛上的岸基航空兵承担的。大概第五舰队的每架轰炸机只出动了三次，一天一次。这个出动效率也是相当低的。
从方孝贤提供的这份情报来看，如果第五舰队的三支特混舰队都参加了作战行动的话，那么美军的目的就不是要炸毁尼华岛上的军事设施，至少由斯普鲁恩斯直接指挥的第五舰队没有这个意图。这显然是在锻炼新人，既让飞行员能够在实际的战斗中体会到那种在训练中是永远也找不到的感觉，掌握一些基本的战斗技巧。又不至于因为高强度的出动，导致飞行员过度疲劳，从而导致更大的战斗损失。这是很合情合理的安排。
这也是第一舰队追上第三舰队前，谈仁皓收到的最有价值的一封情报了，战区司令部发来的其他情报最多只能所是电报，通报了前线各部队的侦察搜索情况。到十九日夜，两支主力舰队会合的时候，谈仁皓仍然不知道第五舰队的行踪。从当时部署在其他几座岛屿上的侦察机所搜索过的海域来判断，第五舰队应该已经离开了前线海域，大概在夏威夷岛东部海域，或者是南部海域活动。
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