公元656年的一次叛乱后，哈里发·乌斯曼（644-656年在位，第3位哈里发。或称奥斯曼，娶了两位穆罕默德的女儿。哈希姆家族。）被杀。
（奥斯曼当政后出于家族观念，重用了众多伍麦叶家族出身的人担任军政要职，如任命艾布·苏富扬之子穆阿维叶出任叙利亚的总督，结果引起了各地***不满，最终导致奥斯曼在79岁时被杀。）
阿里（第四位哈里发）最终继承了教主的位置。但是他的统治只维持了5年。
非正统哈里发（第五位及以后的哈里发）：穆阿维叶与阿里争夺哈里发职位，于657年爆发了隋芬之战。穆阿维叶与阿里的斗争是伍麦叶家族与哈希姆家族间矛盾的集中反映。结果，阿里失败被内部分裂势力暗杀。
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657年，在隋芬之战中，胜利明显地属于阿里一方，但他接受了对方以《古兰经》裁决的和谈要求，阿里队伍中约有12000人坚决反对，从而脱离了阿里的领导，形成哈瓦利吉派。
661年，阿里被一名哈瓦利吉派信士所杀。非正统哈里发：穆阿维叶自立为哈里发，建立了伍麦叶王朝（公元661～750）。***社群组织最高领导权落入伍麦叶家族手中。但斗争仍在进行，并逐渐形成***教的两大派：拥护阿里的一派称什叶派（意为宗派），另一派为逊尼派（意为遵守“逊奈”即圣训），最初，这是一种政治派别，后来，该派在同哈瓦利吉派和什叶派的斗争过程中，建立了自己的政治思想体系，以后又在同穆尔太齐赖派的长期论争中，逐步建立了自己的教义、哲学思想和教法学体系，从而使初期的政治派别转而成为宗教派别。
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在穆阿维叶以哈里发名义所建立的伍麦叶王朝后期，因为宗教教派繁多，哈里发开始拥有了“最高宗教解释权”，即能够对***世界的宗教理论和宗教思想进行最终的裁定。由于出现了“最高宗教审判官（以教法名义审判各种诉讼案件）”和“最高教法说明官（对宗教律例进行解释和说明）”两个职务，穆阿维叶之后的历代哈里发的职责，就更侧重于政治和军事，而非宗教了。整个中世纪的阿拉伯帝国哈里发，相当于阿拉伯帝国皇帝+***最高律法执行官的混合。简单地说，中古时期的哈里发们更加在乎政治和军事上的发展，除了极其特殊的宗教斗争外，他们一般不介入宗教教派的斗争（比如什叶派的夺权，为非正统哈里发，即什叶派哈里发。）。故此，历史上的***国家，其宗教都离不开政治。同样，在***的理解中，宗教的发展和传播也是离不开政治支持的。所以，历史上的很多哈里发视别的宗教教派传扬是政治阴谋或政治运动就一点不奇怪。自此以后，两派彼此互相杀戮，两败俱伤的叛乱、暗杀接连不断。因此，在***教史上，什叶派与逊尼派的关系就形成了长期以来互不信任．彼此为敌的。
1920年，协约国签订《塞夫勒条约》瓜分土耳其。印度等国的***曾掀起保卫***教政教领袖哈里发的运动。土耳其资产阶级革命成功后，实行政教分离。1924年3月宣布废除哈里发。延续了1300多年的哈里发制度遂告终结。
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哈里发在中国：
哈里发在中国完全是一个历史概念，实践中与阿拉伯人理解的哈里发毫不搭界。
①中国内地***以哈里发称呼在清真寺学习宗教知识的学生，类同“满拉”。
②中国***教苏菲神秘主义教团（门宦）中常将其教主特殊培养和指定的接班人称为“哈里发”，意为“高足弟子”或“替位人”。民间尊称“老人家”。
在苏菲教团（门宦）中，哈里发是诵念“迪克尔”功夫最为精深的人，曾经历一种叫“连三九”的坐静功修，就是在门窗紧闭的房屋或窑洞中连续静坐默念“迪克尔”27天。只有度过这种“铁门槛”的人，才能有资格担任“哈里发”，并获得一枚传教印章或教主的衣物及宗教用品作为袭职凭证。
在苏菲教团（门宦）中，教主在世时可以传若干个哈里发，并委派他们到自己管辖的各个地区主持教务（称“热义斯”）。教主去世后，该哈里发往往成为其所在地区的新教主。（余振贵)
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派别：
1、逊尼派（阿拉伯：أهلالسنة Ahl As-sunnah，英：Sunni），***教主要教派之一，全称“逊奈与大众派”。（意为遵守“逊奈”即圣训，亦即“遵循传统者”。选举派）
（占***教人口约85%）
没有集中化的领导。
该派有四大教法学派：
1.1哈乃斐教法学派(a1—Hanafiyyah)
是由8世纪艾布·哈尼法教长所创。因该派学说最初盛行于今伊拉克的库法等地，又称伊拉克学派或库法学派。
该派在创制教法律例时，主要以《古兰经》为据，审慎引用圣训，重视类比和公议。对类比和公议的运用比较灵活变通，尤为强调执法者个人的意见和判决，故以“意见派”着称。该派在释法时，重教法精神甚于教法词句，认为在特殊情况下，可不受类比推理的约束，而以教法官(即卡迪)的优选原则为据，作出更近于公正的判决。
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